去税务办理清税证明显示违法异常怎么回事？

说明有违法行为在案未处理完毕，比如逾期未纳税申报、非正常户等情况存在。
非正常户，是指已办理税务登记的纳税人未按照规定的期限申报纳税，在税务机关责令其限期改正后，逾期不改正的，并经税务机关派员实地核查，查无下落并且无法强制其履行纳税义务的纳税人。

公司代理记账会计联系不上了怎么办？

直接去代理记账公司找啊，之前应该签有相关合同的吧，地址异常可以变更地址，税务异常的话要去税局处理。

经营异常后 办理地税 国税 清税 有影响吗

根据征管法规定，纳税人应当自办理营业执照之日起30日内到国税或者地税办理登记登记（许多地方国、地税合办）。定税是税务人员要提取纳税人的许多数据，如房屋租金、店铺面积、水电费、购销费用、商品毛利率、经营地段、流动资金等等，然后与同地段纳税人税负情况比较，测算核定。测算核定月销售在2万元以下不缴税，超过即按照3%申报纳税。地税一般也是按照国税核定数计算征收有关税费。如缴了国税增值税，就要按照已缴增值税征收城建税和教育费附加。如果没有增值税就不交。其他的如个人所得税，地税按照国税核定的销售额的一定比率简便计算征收，大约1——1.5%之间。

被地税罚2000.理由是超过登记日期3天以后办理

你已经办理了税务登记，剩下的就不要管了。税局（所）会通知你办理下一个程序的。不知道你是做什么行业的，现在全国月营业额20000元以下免税，税局没有通知你，罚款是不对的，再说刚刚营业，即时你有错，也应该先通知你改正。
现在全国各行各业都在强调服务意识，税总同样下发了服务纳税人的公告，你可以跟他们沟通，实在不行就打12366，或者找局长，相信问题会解决的。
另外，工商业、现代服务业是缴纳增值税的，在国税管理，其他的在地税。

祝你好运。